林峻宇 Chun-Yu Lin

從癌症多體學資料解密患者個人化生物標記

我的研究聚焦於精準醫療，致力於開發結合生物網路與多體學資料的疾病調控網路模型，從基因、蛋白質到細胞間等多層次，辨識並解析患者個人化的生物標記與治療標靶，從而推動癌症精準醫療的實踐。我們團隊長期與日本京都大學、臺北醫學大學、臺北榮總及三軍總醫院的學者與醫師合作，在2019-2024年期間共發表19篇SCI期刊論文與3篇國際會議論文。核心技術包含：

(1) 癌症膜蛋白調控網路模型 (《Nature Communications》, 2019)與疾病生化途徑特徵辨識工具 (《Nucleic Acids Research》, 2024)：用於辨識特定疾病或治療條件下的生化途徑特徵，進一步開發藥物標靶與舊藥新用。

(2) 患者個人化網路模型 (《Briefings in Bioinformatics》, 2023)、單細胞網路模型 (《BMC Bioinformatics》, 2024)、以及多層次網路分析模型 (《IEEE-ACM TCBB》, 2023與《BMC Bioinformatics》, 2021)：針對患者樣本與單細胞定序資料，解析病患間及腫瘤內亞克隆間的基因型與表現型變異，進一步辨識個人化生物標記。

這些技術已成功應用於多項研究，例如：發現誘導頭頸癌細胞鐵凋亡可提升免疫療法之效果 (《Advanced Science》, 2023)；揭示猴頭菇菌絲體中的Erinacine S如何透過誘導神經類固醇累積來促進神經元再生 (《Journal of Food and Drug Analysis》, 2023)等。

此外，我亦榮幸獲得日本學術振興會(JSPS)特別研究員獎助 (2017)、國立交通大學BioICT青年講座教授 (2019)、MOST Young Scholar Fellowship (2020)、獲選為臺灣生物資訊與系統生物學會第十屆理事 (2023)、以及113年度吳大猷先生紀念獎 (2024)。我們團隊也積極推動研究成果的產業轉化，於2020和2021年獲得兩項舊藥新用專利，並透過葡萄王生技產學合作，成功將技術應用於天然物產業。